-2001-2004: Biodiversità della vite coltivata e sua protezione dai parassiti. Finanziato dalla Fondazione Bussolera Branca. Ruolo: Coordinatore del WP vite.
-2002-05: FIRB-Sistemi di diagnostica molecolare per l'identificazione e l'analisi di determinanti genetici di rilevanza per l'agroindustria, la zootecnica e l'ambiente. Ente Finanziatore "MIUR". Cod. RBNE01SFXY. Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2005-2008: Progetto Internazionale Italia-Cina - Attività di ricerca e sviluppo sostenibile nel settore delle biotecnologie applicate alla salvaguardia dell’ambiente, in collaborazione con la Repubblica Popolare Cinese. Ente finanziatore "Ministero dell'Ambiente e della Tutela del Territorio e del Mare". Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2004: Testing the holding of Trentino Seed Bank. Ente finanziatore “Museo Tridentino” Provincia di Trento. Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2005-2007: Studio della Biodiversità delle cultivar di vite autoctone della Sardegna. Ente finanziatore “CRAS, Cagliari”. Ruolo: Responsabile scientifico del progetto.
-2007-09: Salvaguardia della biodiversità: conservazione ex situ delle piante lombarde a rischio estinzione. Ente finanziatore "Fondazione Banca del Monte di Lombardia”. Ruolo: Coordinatore generale del progetto.
-2007: Riutilizzo agricolo delle acque: studio degli effetti di xenobiotici ambientali di origine farmaceutica sulla produttività agricola. Ente finanziatore “Fondazione IDRA - Bando di selezione di progetti per l’attuazione di iniziative in merito alla salvaguardia della risorsa idrica e della sostenibilità ambientale". Ruolo: Coordinatore Progetto.
-2008: PRIN-Tassonomia integrata per lo studio della biodiversità vegetale. Ente finanziatore “MIUR”. Ruolo: Coordinatore nazionale.
-2008-2011: Tutela della biodiversità con azioni di riqualificazione e valorizzazione di praterie su suolo calcareo (Festuco Brometalia) nei SIC Monte Sangiano e Monti della Valcuvia. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Biodiversità". Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2008-2009: Acqua in Brocca. Ente finanziatore “Fondazione Cariplo – Bando Educare alla Sostenibilità”. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2008-2011: Connessione ecologica e rinaturazione nel sistema delle aree protette del nord milanese. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Biodiversità". CUP E42D08000160005. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2009-2012: Dai geni all'ecosistema: il DNA barcoding come supporto innovativo per la protezione della biodiversità e l'analisi della funzionalità delle reti ecologiche. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo". CUP H71J08000600003. Ruolo: Coordinatore generale progetto.
-2010: Riduzione degli sprechi domestici in casa: Progetto diretto alla valutazione della qualità dei prodotti agroalimentari. Ente finanziatore "Regione Lombardia - Programma di Tutela dei Consumatore e degli Utenti. Ruolo: Coordinatore generale progetto.
-2009-2011: Insetti Pronubi: mezzi di connessione e diffusione di specie vegetali rare ed endemiche del Parco Regionale della Grigna Settentrionale. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Biodiversità". CUP C91H09000010003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2009-2011: Think Green, persone che hanno cura del territorio. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Educare alla sostenibilità". CUP H41J09000910003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2009-2011: Le connessioni ecologiche nelle selve castanili nel Parco Regionale Campo dei Fiori: valutazione e sviluppo di sistemi di gestione. Ente finanziatore “Fondazione Cariplo - Bando Biodiversità” CUP F87I10000920001. Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2010-2012: Acqua e compost, grandi amici. Ente finanziatore “Fondazione Cariplo- Bando Educare alla sostenibilità”. CUP H41J10000560003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2010-2012: Il corridoio ecologico del Lambro: interventi per il consolidamento e l'implementazione della connettività e della biodiversità. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo -. Bando Biodiversità". CUP B76I10000390005. Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2011: Gestione ecosostenibile delle risorse naturali nel territorio di Santiago Atitlàn. Ente finanziatore "Comune di Milano - Bando Milano per la difesa, incremento e valorizzazione della biodiversità". Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2011-2013: Verso la filiera del gusto sostenibile in Valsassina e Riviera. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Educare alla sostenibilità". CUP C91H09000010003". Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2011: Gestione ambientale e del rischio nel Dipartimento di Sololà. Ente finanziatore "Ambasciata d'Italia in Guatemala - Programma di Emergenza AID 9560". Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2011-2013: L’abbiamo Imbroccata: progetto per la tutela della risorsa idrica. Ente finanziatore “Fondazione Cariplo - Bando Educare alla sostenibilità". CUP H41J11000300003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2011-2013: VIVILATERRA: per la salvaguardia del suolo e della Biodiversità. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo -. Bando Educare alla sostenibilità". CUP H41J11000830003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2012-2014: PROBIOPLUS 4 FOOD – progetto di cooperazione tra centri di ricerca e aziende - ente finanziatore Regione Lombardia - MIUR. CUP E87I11000710004. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2011-2014: Seminare biodiversità: il ruolo dell’avifauna migratrice nell’implementazione della biodiversità del Parco Monte Barro. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando biodiversità" CUP D46H11000120007. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2013-2014: ComunOrto può fare. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Costruire Comunità Sostenibili 2013". CUP H48C13000290003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2014-2016: FraGenziane - Fragmented Gentiana pneumonanthe populations, habitats and associated fauna in local ecological network. Ente finanziatore "Fondazione Cariplo - Bando Connessione ecologica 2014". CUP D82I14000590003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2014-2016: Caffè Corretto - La via del Caffè tra Guatemala, El Salvador e Italia. Ente finanziatore. "Fondo congiunto per Expo 2015 del Comune di Milano, Regione Lombardia e Fondazione Cariplo - Bando Nutrire il Pianeta 2014". CUP H42I14000270003. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2016-2018: Fine Feed for Fish (4F). Enti Finanziatore: AGER- Progetti in Rete per la Ricerca Agroalimentare. CUP H42F15000360007. Ruolo: Coordinatore Unità UNIMIB.
-2016-2018: PILGRIM. Ente Finanziatore: Regione Lombardia – Bando Aggregazione. CUP E47H16001350009. Ruolo: Coordinatore Generale.
-2016-2018: NATHURA. Ente Finanziatore: Regione Lombardia – Bando Aggregazione. CUP E67H16000970009. Ruolo: Membro del team di ricerca.
-2017-2019: Sistemi Agricoli e Sviluppo Sostenibile (SASS). Ente Finanziatore: MIUR –FIRST. CUP E47F17000020009. Ruolo: Coordinatore Generale.